电影与游戏的故事雷同，内容讲述阿星自小在少林寺长大，因为遇上过气足球员明锋到少林寺求易筋经治疗多年的腿伤，意外被发现其足球天份。由于少林寺的易筋经被人偷去，主持派阿星及几个师兄弟下山寻回秘笈，明锋亦随星同行。可是不通世务的星却被人骗去所有路费，在无法可施的情况下只好听明锋的话，利用少林武功来踢足球赚取路费，组成了少林足球队。少林足球队不断有不同的人加入，众人几经苦战后终于打进了全国大赛中。此时发现明峰的宿敌强雄也带领魔鬼足球队争夺全国冠军，更重要的是易筋经也可能落入了强雄手中，到底最后少林足球队能否打败他们取回易筋经？答案尽在《少林足球》游戏中。
比赛模式
电影《少林足球》的故事是以武打、足球和搞笑结合于一身，而这套《少林足球》的游戏模式并不是一般的足球运动游戏那么简单。游戏将会以RPG的形式进行，球场战斗将会采用半动作的方式进行，当相方球员接近时就会进入对战状态，这时玩家可以选择盘球、传球、拦截、铲球、射门等指令，而不同的角色还可以使用独门的必杀技。
比赛规则
由于制作者考虑到操纵问题，所以一场比赛的人数上限为多6人对6人，不过就算不足6人仍可参赛。每场球赛分为上下半场各五分钟，若两队得分相同便要加时进行两分钟的延长赛。仍未能分出胜负的话，就会以黄金入球为比赛方式便要进行无限时延长赛。另外球赛中没有裁判的设定，不会被红牌黄牌赶出场，所以就算打人也不算犯规（晕倒），不过界外球角球等规则仍然存在。
搞笑足球
制作单位为了表现原作中风趣幽默的特色，舍弃仿照真人的做法，由美术人员重新用手绘各Q版造型定案。游戏亦引入了电影原著的搞笑风格，游戏中其他的参战球队的设定亦是各具特色，例如由老汉组成的潮洲老汉队，全是由胖子组成的福健猪排队，也有被冠以「人妖踢足球」的泰国队，至于这些滑稽的人物造型有多搞笑，就要耐心等待到游戏推出时才有分晓了。
